Cinsiyet değiştirme ameliyatı son derece boyutlu bir ameliyattır ve multidisipliner bir yaklaşım gerektirir. Dolayısıyla tek başına bir plastik cerrahi ile yapılabilecek bir uygulama değildir. Psikiyatrist, hormon hastalıkları doktoru, ürolojist, plastik cerrah ve genel cerrahın ekip olarak çalışması gerekir. Transseksüel bir kişi ameliyattan önce kendisini bu sürece çok iyi bir şekilde hazırlamaktadır. Epilasyon, ilaç gibi yöntemlerle yüzündeki ve vücudundaki kıllardan kurtulur. Hormon sorunları için gerekli doktora yönlendirildiğinde, genellikle östrojen, progesteron cinsi hormonlar verilir. Yine hormonla göğüsleri bir miktar, hatta bazılarında bir kadın göğsü kadar büyür. Ancak genellikle bir protez, meme silikonu yapılması gerekir. Bunların dışında, vücuttaki biçimsel değişiklikler plastik cerrah tarafından, ameliyattan önce gerçekleştirilir. Daha kadınsı bir görünüm kazandırmak için, örneğin burnu küçültülür. Kişi sert bir çene yapısına sahipse, hatları yumuşatılır. Alın yapısı değiştirilir. Deri inceltilir, kalça doldurulur. Bu değişiklikleri tamamlamak yaklaşık 2 sene kadar sürer. O arada tıbbi ve hukuki hazırlıklar yapılır. Mahkeme kararının ardından, ameliyat gerçekleştirilir.