Diş kisti ameliyatları, küçük olan kistlerde çok kolaydır. Bazen dişler çekildiğinde, bu kistler diş yoluyla ağızdan çıkabilir. Ama genellikle diş çekilse bile, kist çenenin içerisinde gizli olarak kalmaya devam eder.

O kistin orada bırakılması halinde, ileride ceviz, hatta elma büyüklüğüne ulaşacak olan çene kistlerine dönüşür. Bu nedenle diş çekimlerinde, eğer dişlerde kist varsa mutlaka diş kökündeki kistin kürete edilerek temizlenmesi gerekir. Bu, birinci derece küçük kistler için
önemlidir.

Kistlerin boyutları büyüdüğünde tedavi şekilleri de değişir. Tedavinin biçimine öncellikle cerrah karar verir. Yanı sıra hastanın konumu ve formasyonu da bunu etkiler. Yani büyük bir kisti olan ve önemli bir ameliyat geçirmesi gereken hastanın sosyal yapısı bu ameliyatı kaldıramayacak durumdaysa, bu koşullarda hekim ameliyat tekniğini ve şeklini değiştirebilir.