Erken boşalmanın hem organik hem de psikojenik nedenleri vardır. Aslında erken boşalma sorunu olan erkek, bu sorunu cinsel hayatının başından beri yaşamaktadır. Yani daha çok primardır. Ve çoğunlukla da nedenleri psikojeniktir. Ama bir erkek daha önceden boşalma kontrolü sağladığı halde, sonradan erken boşalma sorunu yaşarsa, bu sekonderdir. Sekonder olanların altında genellikle organik nedenler vardır. Bunlar, örneğin bir erkeğin bir prostat iltihabı geçirmesi olabilir ya da merkezi sinir sistemini etkileyen MS veya farklı bir takım dejeneratif hastalıklar olabilir. Troid hastalığından olabileceği gibi, erkeğin başka bir sertleşme sorununa bağlı ikincil bir sorun olarak gelişebilir. Ancak genel olarak erken boşalma nedeni psikojeniktir. Psikojenik nedenler arasında en önemlisi, yeterli bir cinsel deneyimin olmamasıdır. Erken boşalma sorunu, düzenli bir cinsel hayatı, yeterli cinsel deneyimi olmayan erkeklerde daha sık görülmektedir. Özellikle uygun olmayan ortamlarda gerçekleşen cinsel yaşantılarda, genelev gibi sürenin çok kısıtlı olduğu ortamlarda, yakalanma endişesi altında girilen cinsel ilişkilerde, aceleyle yaşanan cinsel ilişkilerde ya da heyecanlı, aşırı telaşlı kişilerde, boşalma kontrolü çok fazla öğrenilememektedir. Dolayısıyla da erken boşalma sorunu yaşanabilmektedir.