Geç boşalma, organik ve psikojenik nedenlerden kaynaklanabilir. Geç boşalmada rol oynayan organik nedenler arasında en sık karşılaşılanı, kullanılan ilaçlardan kaynaklanandır. Örneğin antidepresan kullanan ve buna bağlı bir boşalma sorunu yaşayan kişi, bu tedavi bittiğinde normal haline dönecektir. Ya da eğer bu tedavide yol alınmışsa, kişi iyileşmeye başlamışsa, ilacı azaltma ya da yavaş yavaş kesme söz konusu olabilir. Dolayısıyla, kişinin geç boşalması ilaçtan kaynaklanıyorsa, ilaç kesildiği zaman, bu sorun ortadan kalkacaktır. Ya da örneğin, altta yatan neden diyabetse, öncelikle kişinin diyabetinin kontrol altına alınması gerekir. Yani geç boşalmanın nedeni organikse, öncelikle bu nedenler ekarte edilmelidir.