Bebekleri hem ishalden korumanın, hem de bağırsaklarının sağlıklı bir şekilde gelişimini sağlamak için, baştan itibaren anne sütü vermek gerekir. Çünkü anne sütünün içinde, ishale karşı koruyucu pek çok doğal madde vardır. Anne sütüyle beslenen bir bağırsak gelişiminin düzeyi bebeğin aynı zamanda onu bakteri ve virüslere karşı da korur.

Bunun dışında, eğer bebeğe yakın birisinde ishal varsa, hijyene dikkat ederek bebekleri korumak mümkündür. Özellikle yaz aylarında, farklı yerlere, tatile gidildiği koşullarda, kullanılan kapların iyice kaynatılması, besinlerin iyice yıkanması, gıdaların bozulmaması çok önemlidir.