Tedavinin amacı öncelikle kök kanalındaki enfekte dokunun kaldırılmasıdır. Bu işlemi takiben kök kanalları temizlenip şekillendirilir ve oluşan boşluk doldurularak daha ileri enfeksiyon engellenmiş olur.

Kök kanal tedavisi beceri ve zaman gerektiren bir tedavidir. Kök kanalının enfeksiyon durumuna göre bir, iki ya da daha fazla seans sürebilir. Seanslar arası kök kanalına ilaç konulur ve diş geçici dolgu ile kapatılır. Dişin tamamen iyileştiği durumda kanal dolgusu yapılır. Dişteki madde kaybı miktarına bağlı olarak diş ya dolgu ile ya da kaplama ile kapatılır.