Bebekler reflüye doğuştan eğilimlidirler. Bunun nedeni ise, sıvı ile beslenmeleri, anatomik olarak bazı yapılarının henüz tam olarak fonksiyon göstermemesidir. Örneğin mide girişindeki, sindirim borusunun altındaki kaslar henüz tam olarak kasılamadığı için, mideden geri kaçan gıdaya engel olamazlar. Yanı sıra, bebeğin vaktinin çoğunu yatarak geçirmesi gibi etkenler, bebeğin reflüye eğilimli olmasına yol açar. Bebeklerde reflü, ilk aylarda da görülür. 6 aya doğru reflünün şiddeti giderek azalır. Çünkü bebek yavaş yavaş oturmaya ve dik pozisyonda vakit geçirmeye başlar. Ek gıdalarla beslenmeye başladığı için, daha katı gıdalarla beslenir.