Hamilelikte idrar yolu enfeksiyonu, normalden daha sık görülür. Bunun birçok nedeni vardır. Öncelikle gebelikte artan progesteronun etkisiyle idrar yollarının her aşamasında idrar durağanlaşır. İdrarı böbrekten idrar yollarına taşıyan idrar kanalcıklarında ve idrar torbasında da durağanlaşır. Bundan dolayı da idrar sıvısı artar. Dolayısıyla idrar yaptıktan sonra bile idrar torbasında kalan bir miktar idrar burada birikerek enfeksiyona neden olur. Ayrıca böbreklerin boyutlarında ve ağırlıklarında değişiklikler olur. Boyları 1-1,5 santim uzar ve ağırlıkları artar. 10 mililitrelik bir hacimde pelvik toplayıcı sistem varken, 60 milimetreye kadar ulaşır. Böbreklerin bu şekilde anatomik değişikliğe uğramasıyla birlikte rahmin, üreter denilen ve böbrekten idrarı taşıyan kanallar üzerinde yaptığı bası da idrar durağanlaşmasını artırır. Bunun yanı sıra uğradığı genişlemeyle birlikte rahim böbrek torbasına da bası yapar ve orada daha çok idrarın kalmasına yol açar. Bütün bu etmenler bir araya gelerek, hamilelikte idrar yolu enfeksiyonunu arttırır.