Polikistik over tedavisinde yerine konulması gereken en önemli şey progesterondur. Bunun için ya vücudun progesteron salgılaması sağlanır ya da bu hormon dışarıdan verilir. Bunun için, çocuk sahibi olmayı planlayan anne adayına, yumurtlama olmadığı için yumurtlamayı sağlayıcı ilaçlar verilmelidir. Ancak kadın hamile kalmayı düşünmüyor ve sadece adet düzensizliğini çözmek istiyorsa, o zaman progesteronun dışarıdan verilmesi gerekir. Eğer bu da yeterli gelmezse, o durumda yumurtlamayı sağlayan tabletlerden iğnelere kadar giden bir tedavi yelpazesi vardır. Yani basitten karmaşığa doğru bir tedavi programı uygulanır. Polikistik overde, yumurtlama sadece durmuş vaziyettedir. Onu uyarmak için çok çeşitli ilaçlar kullanılabilmektedir. Bunlarda başarı oranı yüzde 99’a kadar çıkabilmektedir. Eğer polikistik overin öne çıkan belirtisi tüylenme ve sivilcelenme ise, o zaman tüylenmeyi engelleyici ilaçlar kullanılabilmekte, kalıcı epilasyon da önerilebilmektedir. Ancak epilasyon var olan tüylenmeyi gidermez, yeni tüylerin çıkmasını engeller. Polikistik overde herkeste farklı bir belirti ön plana çıktığı için, tedavinin de kişiye özel olması gerekir.