Dengeli bir beslenmenin, çocuklarda bağışıklık sisteminin güçlenmesiyle yakından ilişkisi vardır. Çocuklar günlük olarak yaşlarına uygun kalorilerini almalı, az az ve sık sık beslenmelidirler. Bağışıklık sistemini güçlendiren besinlerin neler olduğunu bilmek ve çocukların bunları tüketmesini sağlamak da çok önemlidir. Bu konuda en önemli besin grubu, çiğ meyve ve sebzelerdir. Sebzelerin çiğ olarak tüketilmesi, bağışıklık sistemini güçlendiren önemli bir etkendir. Bunların içinde özellikle bağışıklık desteği olan ve içinde selenyum bulunan sarımsak, ayrıca kırmızı soğan çiğ tüketilebilir. C vitamini içeren meyve ve sebzeleri tüketmek önemlidir. C vitamini pek çok sebze ve meyvede bulunur. Bunların dışında da çiğ sebze ve meyvelerde, bağışıklık sistemini destekleyen çok sayıda faktör bir aradadır. Omega 3 ve balık yağlarının bağışıklığı desteklemekteki önemi yeni yeni keşfedilmektedir. Bu yağların bağışıklık sistemine katkıları son derece önemlidir.

Son yıllarda hijyen hipotezi diye bir hipotez tartışılmaya başlanmıştır. Henüz kesin olarak kanıtlanmamış olmakla birlikte, bilim dünyasında gittikçe daha çok destek görmektedir. Bu hipoteze göre, ortam ne kadar steril olursa, bağışıklı sistemi o kadar kendine doğru çalışmaya başlar. Dolayısıyla kendine zarar verir. O nedenle bağışıklık sistemini sağlıklı olarak geliştirebilmek için fermente gıdalara erken başlamak ve kişinin bağışıklığını güçlendirecek bir ortamda bulunmak gerekir. Yani kişi mikroplara ve virüslere de maruz kalabilmelidir. Fermente gıdalar söz konusu olduğunda, yoğurt, boza, kefir gibi gıdalar tüketilebilir. Bunlar doğal prebiyotiklerdir. Prebiyotikler doğal yolla alınamadığı zaman katkı olarak da alınabilmektedir. Bu gıdalara çocuklarda erken başlanması gerekir. Çünkü son yıllarda bebek beslenmesinde, Batı ülkelerinde fermente gıdalara daha geç geçiş başlamıştır. Bu uygulamanın aslında bağışıklık sisteminin güçlendirilmesinde yanlış bir yöntem olduğu, fermente gıdalara erken başlamanın bağışıklık sistemini güçlendirici bir etkisi olduğu bilinmektedir.